fix: фаза 2 — критические фиксы

READМЕ: убрать NEXUS_REPOSITORIES, CREATED→UPDATED, go/npm/Gem→go/npm,
  добавить MAX_CONCURRENT_SCANS, CSV-экспорт, инструкцию по вебхукам Nexus
Dockerfile: uv pip install --system . (единый источник deps — pyproject.toml)
docker-compose: WEBHOOK_SECRET, SCAN_TIMEOUT_SECONDS
pyproject.toml: убрать deprecated [tool.ruff].select
config.py: default из DEFAULT_MAX_CONCURRENT_SCANS
constants.py: убрать GUARDDOG_ERRORS_KEY (мёртвый), .gem из PACKAGE_EXTENSIONS,
  LLM prompt: «Python»→«software»
queries.py: убрать return_total
Makefile: docker-up +--build, docker-down без -v, +docker-destroy,
  +docker-rebuild, убран typecheck

guarddog_nexus/db/queries.py

@@ -35,7 +35,6 @@ def build_scan_list_query(
     sort_dir: str = "desc",
     limit: int = 50,
     offset: int = 0,
-    return_total: bool = True,
 ):
     """Builds a filtered, sorted, paginated query for scans.