fix: фаза 2 — критические фиксы

READМЕ: убрать NEXUS_REPOSITORIES, CREATED→UPDATED, go/npm/Gem→go/npm,
  добавить MAX_CONCURRENT_SCANS, CSV-экспорт, инструкцию по вебхукам Nexus
Dockerfile: uv pip install --system . (единый источник deps — pyproject.toml)
docker-compose: WEBHOOK_SECRET, SCAN_TIMEOUT_SECONDS
pyproject.toml: убрать deprecated [tool.ruff].select
config.py: default из DEFAULT_MAX_CONCURRENT_SCANS
constants.py: убрать GUARDDOG_ERRORS_KEY (мёртвый), .gem из PACKAGE_EXTENSIONS,
  LLM prompt: «Python»→«software»
queries.py: убрать return_total
Makefile: docker-up +--build, docker-down без -v, +docker-destroy,
  +docker-rebuild, убран typecheck

Makefile

@@ -1,4 +1,4 @@
-.PHONY: install dev test lint format typecheck docker-build docker-up docker-down clean
+.PHONY: install dev test lint format docker-build docker-up docker-down docker-destroy docker-rebuild docker-logs clean
 
 install:
 	pip install -e .
@@ -16,18 +16,21 @@ format:
 	ruff format guarddog_nexus tests
 	ruff check --fix guarddog_nexus tests
 
-typecheck:
-	mypy guarddog_nexus
-
 docker-build:
 	docker compose build
 
 docker-up:
-	docker compose up -d
+	docker compose up -d --build
 
 docker-down:
+	docker compose down
+
+docker-destroy:
 	docker compose down -v
 
+docker-rebuild:
+	docker compose down && docker compose up -d --build
+
 docker-logs:
 	docker compose logs -f