fix: фаза 2 — критические фиксы

READМЕ: убрать NEXUS_REPOSITORIES, CREATED→UPDATED, go/npm/Gem→go/npm,
  добавить MAX_CONCURRENT_SCANS, CSV-экспорт, инструкцию по вебхукам Nexus
Dockerfile: uv pip install --system . (единый источник deps — pyproject.toml)
docker-compose: WEBHOOK_SECRET, SCAN_TIMEOUT_SECONDS
pyproject.toml: убрать deprecated [tool.ruff].select
config.py: default из DEFAULT_MAX_CONCURRENT_SCANS
constants.py: убрать GUARDDOG_ERRORS_KEY (мёртвый), .gem из PACKAGE_EXTENSIONS,
  LLM prompt: «Python»→«software»
queries.py: убрать return_total
Makefile: docker-up +--build, docker-down без -v, +docker-destroy,
  +docker-rebuild, убран typecheck

Dockerfile

@@ -8,8 +8,7 @@ COPY --from=ghcr.io/astral-sh/uv:latest /uv /uvx /usr/local/bin/
 WORKDIR /app
 
 COPY pyproject.toml ./
-RUN uv pip install --system fastapi uvicorn[standard] jinja2 httpx \
-    "sqlalchemy[asyncio]" aiosqlite python-multipart
+RUN uv pip install --system .
 
 RUN uv pip install --system guarddog